Utilizzando colormap con bokeh dispersione

Question

Nel matplotlib il scatterplot offre la possibilità di utilizzare il colore di un complotto per indicare il valore o grandezza come questa trama:

Per bokeh, simile examples sembrano generare manualmente il colori RGB, che rende difficile la produzione di grafici con il colore ridimensionato per grandezza, esp. WRT. colormaps divergenti.

È possibile avere funzionalità simili in bokeh o utilizzare i colori del colore matplotlib per impostare il colore?

Answer 1

È abbastanza semplice utilizzare direttamente le mappe del colore matplotlib. Ad esempio, il seguente usa viridis in bokeh s' esempio (nota che sto utilizzando un notebook jupyter):

import numpy as np 

from bokeh.plotting import figure, show, output_notebook 
import matplotlib as mpl 

output_notebook() 

N = 4000 
x = np.random.random(size=N) * 100 
y = np.random.random(size=N) * 100 
radii = np.random.random(size=N) * 1.5 
colors = [ 
    "#%02x%02x%02x" % (int(r), int(g), int(b)) for r, g, b, _ in 255*mpl.cm.viridis(mpl.colors.Normalize()(radii)) 
] 

p = figure() 

p.scatter(x, y, radius=radii, 
      fill_color=colors, fill_alpha=0.6, 
      line_color=None) 

show(p) 

In sostanza, per ogni colormap matplotlib in cm, inizializzandolo con una serie di valori restituirà un array con ogni valore sostituito da [r, g, b, a] valori nell'intervallo [0,1]. Si noti che questo presuppone che tutti i valori siano compresi tra 0 e 1; qui uso matplot.colors.Normalize per garantire questo.