Uso del layout con knitr

Question

Voglio creare una singola figura in R con due grafici in un file markdown con knitr. Normalmente, questo è facile da fare con layout(t(1:2)) o par(mfrow=c(1,2)). Posso farlo con knitr, o farà sempre due figure separate?

Ecco un esempio di lavoro minimo che crea un file chiamato ./junk.Rmd e ./junk.md nella vostra directory di lavoro insieme a due file ./figure/junkislands1.png (che comprende solo il primo trama) e ./figure/junkislands2.png (che include entrambe le trame che voglio).

require(knitr) 
temp <- "```{r junkislands, fig.width=8, fig.height=5} 
layout(t(1:2)) 
pie(islands) 
barplot(islands) 
```" 
cat(temp, file="junk.Rmd") 
knit("junk.Rmd", "junk.md") 

Il problema non è tanto che esso crea due file .png, ma piuttosto che il file Markdown junk.md include entrambi.

Quando faccio questo markdown in html, include entrambi i file .png quando voglio solo quello con entrambe le figure tracciate.

Ecco il file junk.md che viene generato da knitr:

```r 
par(mfrow = c(1, 2)) 
pie(islands) 
``` 

![plot of chunk junkislands](figure/junkislands1.png) 

```r 
barplot(islands) 
``` 

![plot of chunk junkislands](figure/junkislands2.png) 

Answer 1

Dai un'occhiata alla http://yihui.name/knitr/options e specificatamente fig.keep. Penso che si desidera fig.keep = 'last'

require(knitr) 
temp <- "```{r junkislands, fig.width=8, fig.height=5, fig.keep = 'last'} 
layout(t(1:2)) 
pie(islands) 
barplot(islands) 
```" 
cat(temp, file="junk.Rmd") 
knit("junk.Rmd", "junk.md") 

dà

```r 
layout(t(1:2)) 
pie(islands) 
barplot(islands) 
``` 

![plot of chunk junkislands](figure/junkislands.png)