Desidero utilizzare hclust per raggruppare un dato. Ma non voglio usare "dist()" per generare l'oggetto dist. Poi ho scoperto che non posso passare una matrice simmetrica come matrice di distanze in hclust.Come convertire una matrice simmetrica in oggetto "dist"?
Come convertire una matrice simmetrica in oggetto "dist"?
Sembra che si sia già calcolata una matrice e si desidera utilizzarla in hclust. Come ha detto @shadow, è possibile utilizzare as.dist(yourMatrix) per convertire nel formato dist.
dato un tavolo simmetrica delle distanze:
> yourMatrix<-matrix(c(1,2,3,4,2,1,2,1,3,2,1,3,4,1,3,1), nrow=4)
[,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 1 2 3 4
[2,] 2 1 2 1
[3,] 3 2 1 3
[4,] 4 1 3 1
>
>as.dist(yourMatrix)
1 2 3
2 2
3 3 2
4 4 1 3
Assicurarsi che i valori nella tua matrice sono dissomiglianza, o metriche di distanza, piuttosto che i punteggi di somiglianza.
È questo ciò che ti serve? dist(matrix(1:16, nrow=4))