Importazione del metodo S3 da un altro pacchetto

Question

Sto tentando di importare un metodo S3, predict da un altro pacchetto pls. Ho una funzione che utilizza questi valori previsti. Il problema è che, quando si compila il pacchetto:

Error : object 'predict' is not exported by 'namespace:pls' 

Ho messo insieme this Gist come un esempio minimo che mette in evidenza il mio problema e contiene il seguente file R:

#' Test function 
#' 
#' @importFrom pls predict 
#' 
#' @export 

myfunc <- function(x){ 
    stopifnot(class(x) == "mvr") 
    predict(x)*2 
} 

Answer 1

Il problema principale qui è la pls non definisce una funzione/metodo predict. Fornisce diversi metodi per il generico predict, ma non per il generico stesso.

È necessario importare il generic dal pacchetto stats, se necessario, non sono sicuro che lo si faccia perché non si sta creando una funzione che necessita o si basa sul generico. Come minimo avrete bisogno

#' @importFrom stats predict 

anche se potrebbe essere necessario/voler importare l'intero statistiche namespace - dipende che cosa il vostro pacchetto fa al di là della funzione di vostro stanno attualmente lavorando.

L'altra questione è che predict.mvr è non esportati dalla pls namespace

> require(pls) 
Loading required package: pls 

Attaching package: ‘pls’ 

The following object(s) are masked from ‘package:stats’: 

    loadings 

> predict.mvr 
Error: object 'predict.mvr' not found 
> pls::predict.mvr 
Error: 'predict.mvr' is not an exported object from 'namespace:pls' 
> pls:::predict.mvr 
function (object, newdata, ncomp = 1:object$ncomp, comps, type = c("response", 
    "scores"), na.action = na.pass, ...) 

Come tale non si può semplicemente importarlo. Quindi il pacchetto deve avere Depends: pls nello DESCRIPTION per trovare il metodo corretto predict.