Provare a fare un diagramma di rete in R. Come si allungano i bordi in un grafico di rete usando IGraph?Come allungare i bordi in un grafico di rete in igraph (layout = fruchterman.reingold)?
In realtà desidero utilizzare il layout di fruchterman-reingold. C'è un modo per rendere questo algoritmo basato sulla forza "più elastico" in modo che i miei vertici siano più distanti?
grazie.
È possibile controllare l'algoritmo di Fruchterman-Reingold utilizzando la funzione layout.fruchterman.reingold. vedi: help('layout.fruchterman.reingold'). Una configurazione che uso spesso e si ottiene un po 'più di distanza è:
l <- layout.fruchterman.reingold(g,niter=500,area=vcount(g)^2.3,repulserad=vcount(g)^2.8)
plot(g,layout=l)
dove g è il vostro oggetto grafico. Meglio solo testare diversi valori di questi parametri per il tuo grafico e vedere cosa funziona. Soprattutto lo repulserad influenza la spaziatura in un grafico. Il valore predefinito è il quadrato del numero di nodi, quindi valori più alti dovrebbero ottenere grafici più spaziati.
"L'argomento' repulserad 'è deprecato e non ha alcun effetto ", almeno in v.1.0.1. . – WAF
Se l'algoritmo layout.fruchterman.reingold continua a non fornire ciò che si desidera modificando i parametri, procedere come segue. Ogni layout restituisce un insieme di coordinate, con la coordinata x e y rispettivamente nella prima e nella seconda colonna. È possibile applicare alcuna trasformazione che ti piace qui, e se vorrei solo in scala, è sufficiente utilizzare
L = layout.fruchterman.reingold(G)*s; #Scaling factor s
trasformazioni più fantasia sono naturalmente anche possibile. Solo per la cronaca, puoi anche modificare il layout manualmente con il tuo mouse usando tkplot(G, layout=L). È possibile ottenere le coordinate indietro tramite L = tkplot.getcoords(1).
il ridimensionamento di una costante non ha alcun effetto, a meno che non si dia il parametro 'rescale = FALSE' alla funzione' igraph :: plot' – deeenes
Qualsiasi soluzione per questo? –