Sto eseguendo una meta-analisi di dati epidemiologici in cui gli studi possono essere separati in due gruppi (ad esempio mediante metodologia). C'è un modo per modificare i punti tracciati sul grafico a imbuto per identificare i gruppi (ad esempio punti e croci)?
(Proprio come fa pch.fill quando viene utilizzato il trimfill) Grazie.Tracciamento di due insiemi di punti dati sul tracciato a imbuto (metafor per R)
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A
risposta
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Per ogni studio, dovrebbe esserci un indicatore che mostri se è il metodo A del metodo B, giusto? Supponiamo che la variabile si chiami StudyType (= 16 se metodo A, = 17 se metodo B), quindi puoi tracciarli con simboli diversi specificando "pch = StudyType." La trama utilizzerà pch = 16 per TypeA e pch = 17 per TypeB.
### load BCG vaccine data
data(dat.bcg)
### Attach study type (I just randomly made up some here):
StudyType = sample(c(16,17),13,replace=T)
### meta-analysis of the log relative risks using a random-effects model
res <- rma(ai=tpos, bi=tneg, ci=cpos, di=cneg,
data=dat.bcg, measure="RR", method="REML")
### standard funnel plot (Notice the pcd command)
funnel(res, pch=StudyType)
+0
Grazie - è molto utile – Cullen
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Stai parlando sul comando imbuto()? Accetta l'opzione pch. Vedi pagina 81 del [documento tecnico] (http://cran.r-project.org/web/packages/metafor/metafor.pdf). –
Forse non ero chiaro come avrei dovuto. Voglio tracciare due gruppi separati di punti sullo stesso funnel (dalla stessa meta-analisi). Ogni gruppo rappresenta un sottogruppo all'interno dell'analisi. Come posso cambiare i punti tracciati per rappresentare i gruppi in modo diverso? Pch sembrerebbe cambiare tutti i punti tracciati, grazie – Cullen
Per ogni studio, ci dovrebbe essere un indicatore che mostri se è il metodo A del metodo B, giusto? Supponiamo che la variabile si chiami StudyType (= 1 se metodo A, = 2 se metodo B), quindi puoi tracciarli con simboli diversi specificando "pch = StudyType." Il grafico utilizzerà pch = 1 per TypeA e pch = 2 per TypeB. –