Ho un codice C per il calcolo parallelo scritto per gcc e desidero compilarlo su un cluster, che apparentemente utilizza icc tramite mpicc. Correggere il codice da icc sembra troppo impegnativo per il tempo, quindi mi chiedo se posso chiedere allo OpenMPI di usare gcc. Non ho i diritti di amministratore su quel cluster e in realtà preferirei non modificare la configurazione originale.Come forzare OpenMPI ad usare GCC invece di ICC? È necessario ricompilare OpenMPI?
Se non è possibile impostare ad es. Makefile, quindi potrei eventualmente compilare OpenMPI nella mia home directory, ma ho bisogno di una guida su ciò che deve essere fatto dopo. Potresti aiutarmi?
Update1
Il Makefile contiene
CC = mpicc
CFLAGS += -DMPI
e qui ci sono alcuni file openmpi
$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
lrwxr-xr-x /usr/bin/mpicc -> opal_wrapper
-rwxr-xr-x /usr/bin/opal_wrapper
fatemi sapere, se posso fornire ulteriori informazioni.
UPDATE2
Con la help of Jeff, sono stato in grado di trovare OpenMPI impostazioni per mpicc
$ more /usr/local/share/openmpi/mpicc-wrapper-data.txt
project=Open MPI
project_short=OMPI
version=1.1.4
language=C
compiler_env=CC
compiler_flags_env=CFLAGS
compiler=icc
extra_includes= openmpi
preprocessor_flags=
compiler_flags=-pthread
linker_flags=
libs=-lmpi -lorte -lopal -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -lutil -ldl
required_file=
Tuttavia, non ho diritto di modificare questo file, e OPMI_CC = gcc doesn' t cambia il compilatore.
Update3
variabile ambientale CC = gcc non aiuta
$ export CC=gcc
$ echo $CC
gcc
$ make clean $$ make
...icc:...errors
Update4
... ma export OMPI_CC=gcc fa pinna aiuto alleato (thanks to sharth). Dovrei uno giorno ricordo che queste sono cose diverse ...
Nonostante che il binario è stato creato, ho ricevuto il seguente messaggio di bye-bye
/opt/intel/fce/9.1.036/lib/libimf.so: warning: warning: feupdateenv is not implemented and will always fail
'Makefile' ha' CC = mpicc' e 'CFLAGS + = -DMPI'. Altrimenti, non otterrò l'interfaccia 'mpi'. È corretto? – Andrei
@Andrei: Quelle non sono variabili ambientali.Tu vuoi quelli così come impostare le variabili ambientali che ho suggerito sopra. –
OK, vedo il mio errore. Ho appena provato come suggerisci, ed è ancora 'icc'. Potresti dare un'occhiata alla pagina suggerita da Jeff? Faccio come dice? – Andrei