logaritmiche bidoni asse y in pitone

Question

sto cercando di creare un istogramma di una colonna di dati e tracciare lo logaritmicamente (y-axis) e io non sono sicuro perché il seguente codice non funziona:

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 
data = np.loadtxt('foo.bar') 
fig = plt.figure() 
ax = fig.add_subplot(111) 
plt.hist(data, bins=(23.0, 23.5,24.0,24.5,25.0,25.5,26.0,26.5,27.0,27.5,28.0)) 
ax.set_xlim(23.5, 28) 
ax.set_ylim(0, 30) 
ax.grid(True) 
plt.yscale('log') 
plt.show() 

Ho anche provato invece di plt.yscale('log') aggiungendo Log=true nella riga plt.hist e anche io ho provato ax.set_yscale('log'), ma niente sembra funzionare. O ottengo una trama vuota, o lo y-axis è in effetti logaritmico (con il codice come mostrato sopra), ma non ci sono dati tracciati (niente bidoni).

Answer 1

prova

plt.yscale('log', nonposy='clip') 

http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html#matplotlib.pyplot.yscale

Il problema è con la parte inferiore di barre essendo in y = 0 e il difetto è quello di mascherare in validi punti (log(0) -> indefinito) quando si fa la log transformation (c'era una discussione su come cambiarlo, ma non ricordo da che parte fosse andato) così quando tenta di disegnare i rettangoli per il tuo grafico a barre, il bordo inferiore è mascherato -> nessun rettangolo.

Answer 2

np.logspace torna bidoni in [1-10], logaritmicamente distanziati - nel mio caso xx è un npvector> 0 in modo che il codice seguente fa il trucco

logbins=np.max(xx)*(np.logspace(0, 1, num=1000) - 1)/9 
hh,ee=np.histogram(xx, density=True, bins=logbins)