2012-02-16 11 views
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C'è un modo veloce per trovare quali righe nella matrice A sono presenti nella matrice B? ad es.Confronto di righe tra due matrici

m1 = matrix(c(1:6), ncol=2, byrow = T); m2 = matrix(c(1:4), ncol=2, byrow=T); 

e il risultato sarebbe 1, 2.

Le matrici non hanno lo stesso numero di righe (numero di colonne è lo stesso), e sono alquanto big - da 10^6 - 10^7 numero di righe.

Il modo più veloce di farlo, che io sappia, per ora, è:

duplicated(rbind(m1, m2)) 

Tnx!

+2

La soluzione con 'duplicato' restituirebbe anche qualsiasi riga ripetuta all'interno di una matrice, anche se appare in una sola delle due matrici. Ad ogni modo, la risposta di @ MatthewDowle è ottima. –

+1

'data.table' potrebbe essere più veloce perché non usa' do.call ("incolla" 'sotto il cofano .Se preferisci' duplicato' a 'M2 [M1]' poi 'duplicato (as.data.table (rbind (m1, m2))) 'potrebbe essere più veloce, per lo stesso motivo Interessato a vedere i tuoi orari –

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@David Oh sì, buon punto sull'approccio' duplicato' –

risposta

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Un modo veloce per quel formato dovrebbe essere:

require(data.table) 
M1 = setkey(data.table(m1)) 
M2 = setkey(data.table(m2)) 
na.omit(
    M2[M1,which=TRUE] 
) 
[1] 1 2 
-1

ho creato questa funzione che restituirà l'ID originale. Ad esempio si desidera associare la matrice x alla matrice y, restituirà l'ID della corrispondenza di y.

rowiseMatch2 <- function(x,y){ 
    require(data.table) 
    keycols <- colnames(x) 
    x <- cbind(x, id=1:nrow(x)) 
    y <- cbind(y, id=1:nrow(y)) 
    m1 = data.table(x) 
    setkeyv(m1, keycols) 
    m2 = data.table(y) 
    setkeyv(m2, keycols) 
    m1id <- m1$id 
    m2id <- m2$id 

    m1$id <- NULL 
    m2$id <- NULL 

    m <- na.omit(m2[m1,which=TRUE]) 
    mo <- m2id[m][order(m1id)] 

    if(length(mo) == nrow(x)){ 
    cat("Complete match!\n") 
    }else{ 
    cat("Uncomplete match, match percentage is:", round(length(mo)/nrow(x), 4)*100, "%\n") 
    } 
    return(as.integer(mo)) 
}