Quando uso write.fasta nel seqinr, il file che emette assomiglia a questo: >Sequence name 1
>Sequence name 2
>Sequence name 3
...etc
Sequence 1 Sequence 2 Sequence 3 ...etc
In altre parole, i
Sto cercando di capire i passaggi di base dell'algoritmo FASTA nella ricerca di sequenze simili di una sequenza di query in un database. Questi sono i passi dell'algoritmo: Identificare incontrate k-p
Sto scrivendo del codice che deve leggere fasta files, quindi parte del mio codice (incluso sotto) è un parser fasta. Poiché una singola sequenza può estendersi su più righe nel formato fasta, ho biso