2014-11-10 12 views
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Mi sembra che questo dovrebbe essere ovvio ... tutto quello che sto cercando di fare è rimuovere l'asse x dal fondo del mio grafico e aggiungerlo in cima.Mettere l'asse x nella parte superiore del grafico ggplot2

Ecco un esempio riproducibile. I dati più codice per rendere il seguente grafico:

library(reshape2) 
library(ggplot2) 

data(mtcars) 
dat <- with(mtcars, data.frame(mpg, cyl, disp, hp, wt, gear)) 
cor.matrix <- round(cor(dat, use = "pairwise.complete.obs", method = "spearman"), digits = 2) 
diag(cor.matrix)<-NA 

cor.dat <- melt(cor.matrix) 
cor.dat <- data.frame(cor.dat) 
cor.dat <- cor.dat[complete.cases(cor.dat),] 


ggplot(cor.dat, aes(Var2, Var1, fill = value)) + 
    geom_tile(colour="gray90", size=1.5, stat="identity") + 
    geom_text(data=cor.dat, aes(Var2, Var1, label = value), color="black", size=rel(4.5)) + 
    scale_fill_gradient(low = "white", high = "dodgerblue", space = "Lab", na.value = "gray90", guide = "colourbar") + 
    scale_x_discrete(expand = c(0, 0)) + 
    scale_y_discrete(expand = c(0, 0)) + 
    xlab("") + 
    ylab("") + 
    theme(panel.grid.major = element_blank(), 
     panel.grid.minor = element_blank(), 
     panel.border = element_rect(fill=NA,color="gray90", size=0.5, linetype="solid"), 
     axis.line = element_blank(), 
     axis.ticks = element_blank(), 
     panel.background = element_rect(fill="gray90"), 
     plot.background = element_rect(fill="gray90"), 
     legend.position = "none", 
     axis.text = element_text(color="black", size=14)) 

enter image description here

Ma quello che sto cercando di produrre è- sembra che questo dovrebbe essere ovvio (ad esempio, è molto facile da fare in base-R) , ma non sono riuscito a trovare quello che sto cercando in ggplot2.

enter image description here

+0

Gli assi in ggplot non sono altrettanto flessibile come nella base R. Per il tuo esempio, non stai usando alcun componente dell'asse tranne le etichette. Direi che la soluzione migliore è non tracciare un asse, e basta usare 'geom_text' per mettere le etichette dove vuoi. – Gregor

+2

Lo spostamento dell'asse x è difficile, ma è possibile utilizzando le funzioni ggplot_gtable e ggplot_build. Queste funzioni "tracciano" il ggplot, ma anziché lo schermo, rendono "grob" i cosiddetti oggetti che rappresentano gli elementi visivi (una scatola, una linea, una griglia, ecc.), Ma su un livello diverso rispetto agli oggetti ggplot (scale , temi, estetica, ecc.). Puoi manipolare i grobs come meglio credi, scambiandoli, ridimensionandoli ecc. – MrGumble

+0

A meno che tu non stia automatizzando questo, potresti semplicemente voler fare la figura e poi modificarla dopo il fatto. Ci vorrebbero alcuni secondi per spostare l'asse in Illustrator o Inkscape. – Minnow

risposta

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È possibile spostare le etichette di asse x per la parte superiore aggiungendo

scale_x_discrete(position = "top") 
+5

Grazie a https://github.com/thomasp85 per aver reso possibile tutto questo! – jalapic

-1

L'unico modo che posso pensare di fare questo è quello di andare selvaggio con l'opzione vjust tema per le etichette degli assi (e il titolo dell'asse così, suppongo). Qualcosa come:.

df <- data.frame(x = 1:10, y = (1:10)^2)  # example data 

p <- ggplot(df, aes(x = x, y = y)) + geom_point() + 
    theme(
     axis.text.x = element_text(vjust = -5), 
     axis.title.x = element_text(vjust = -5)) 

vjust non funziona con element_text, però, così io "m bloccato su spostando l'asse zecche

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Ho usato questa soluzione ha utilizzato un duplicato X- della trama. asse e apposto i due insieme, poi raccolto. non ho il codice ripulito, ma sotto è un esempio.

p.bot <- 
ggplot(cor.dat, aes(Var2, Var1, fill = value)) + 
    geom_tile(colour="gray90", size=1.5, stat="identity") + 
    geom_text(data=cor.dat, aes(Var2, Var1, label = value), color="black", size=rel(4.5)) + 
    scale_fill_gradient(low = "white", high = "dodgerblue", space = "Lab", na.value = "gray90", guide = "colourbar") + 
    scale_x_discrete(expand = c(0, 0)) + 
    scale_y_discrete(expand = c(0, 0)) + 
    xlab("") + 
    ylab("") + 
    theme(panel.grid.major = element_blank(), 
     panel.grid.minor = element_blank(), 
     panel.border = element_rect(fill=NA,color="gray90", size=0.5, linetype="solid"), 
     axis.line = element_blank(), 
     axis.ticks = element_blank(), 
     panel.background = element_rect(fill="gray90"), 
     plot.background = element_rect(fill="gray90"), 
     legend.position = "none", 
     axis.text.x = element_blank(), 
     plot.margin = unit(c(1,0,0,0), "cm"), 
     axis.text.y = element_text(color="black", size=14)) 

p.top <- p.bot + theme(
    axis.text.x = element_text(color="black", size=14), 
    axis.text.y = element_text(color="gray90", size=14) 
    ) + coord_cartesian(ylim = c(0,0)) 



require(gtable) 
#Extract Grobs 
g1<-ggplotGrob(p.top) 
g2<-ggplotGrob(p.bot) 
#Bind the tables 
g<-gtable:::rbind_gtable(g1, g2, "first") 
#Remove a row between the plots 
g <- gtable_add_rows(g, unit(-1.25,"cm"), pos=nrow(g1)) 
#draw 
panels <- g$layout$t[grep("panel", g$layout$name)] 
g$heights[panels] <- lapply(c(0,2), unit, "null") 

grid.newpage() 
grid.draw(g) 

enter image description here

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controllo il cowplot package

ggdraw(switch_axis_position(p + axis = 'x')) 
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Sotto la versione corrente di cowplot, avevo bisogno di scambiare il più per una virgola: ggdraw (switch_axis_position (p, axis = 'x')) –

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vedi http://ggplot2.tidyverse.org/reference/sec_axis.html

scale_y_continuous(sec.axis = dup_axis()) 
+0

Considera l'espansione della risposta spiegando cosa fa il codice/perché risolve il problema dell'OP e riassume i dettagli disponibili al link condiviso. –

+0

Sebbene questo snippet di codice possa essere la soluzione, anche una spiegazione aiuta davvero a migliorare la qualità del post. Ricorda che stai rispondendo alla domanda per i lettori in futuro, e queste persone potrebbero non conoscere le ragioni del tuo suggerimento sul codice –

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