Sto tentando di utilizzare una funzione simile a, se non addirittura, regsubsets nel pacchetto leaps nel programma R quando si selezionano i migliori modelli Cox Proportional Hazards per i miei dati. È possibile? e se così esiste già una funzione?È possibile eseguire la selezione di tutte le variabili secondarie per un modello di rischio proporzionale di Cox in R?
5
A
risposta
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Sto indovinando sei già familiarità con il seguente ... Se si sta utilizzando AIC come criterio per la 'top model', allora questo sarebbe un ragionevole punto di partenza:
library(survival)
data(colon)
c1 <- coxph(Surv(time=time, event=status) ~
as.factor(extent) + age + sex, data=colon)
step(c1)
Attenzione con questo se mancano valori (NA
). Naturalmente, potrebbe esserci un modello migliore che non viene trovato con questo metodo, ma con un numero limitato di potenziali predittori che è improbabile che manchi. Avvertenze come sopra (grazie a @DWin) sull'utilizzo di metodi numerici in cui un parere informato può essere più affidabile.
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In primo luogo dovresti seriamente mettere in dubbio se sia una buona idea. –
Quale procedura di selezione del modello consigliate? Non è appropriato vedere quanto sono vicini i modelli concorrenti prima di accettare un modello come il "migliore"? – marcellt
Dovresti innanzitutto pensare alla scienza di base nel dominio dell'investigazione. Non è possibile raccomandare una "procedura migliore" a meno che gli obiettivi non siano chiari. –