Homebrew R costruire manca Cairo

ho installato R su un OSX 10.7.5 server utilizzando birra:Homebrew R costruire manca Cairo

brew install R

Tutto sembra così lontano OK, però Cairo non sta funzionando:

> svg(tempfile()) 
Warning messages: 
1: In svg(tempfile()) : 
    unable to load shared object '/usr/local/Cellar/r/2.15.2/R.framework/Resources/library/grDevices/libs//cairo.so': 
    dlopen(/usr/local/Cellar/r/2.15.2/R.framework/Resources/library/grDevices/libs//cairo.so, 6): image not found 
2: In svg(tempfile()) : failed to load cairo DLL

L'oggetto condiviso il file sembra mancare del tutto:

id-86-243:Resources jeroen$ ls -ltr library/grDevices/libs/ 
total 488 
-rwxrwxr-x 1 jeroen admin 245764 Dec 22 17:03 grDevices.so

io uso raramente OSX, quindi non sono del tutto sicuro se questo è un bug in questo particolare distribuzione di R, o se ho fatto qualcosa di sbagliato durante la costruzione?

fonte

2012-12-23 Jeroen

ISTR che Simon Urbanek scoraggia le persone dall'uso di homebrew per compilare R. Il 4 novembre 2012 nel MacSIG ha scritto: "Non puoi utilizzare i binari di CRAN con homebrew. Se usi homebrew, sei completamente da solo e devi costruire tutto da fonti. " –

Va bene. In Linux installiamo sempre pacchetti anche dal sorgente. grDevices è base R però. – Jeroen

I pacchetti predefiniti includono sia 'base' che 'grDevices', ma grDevices non è nel pacchetto 'base'. –

Mi sono appena imbattuto in questo problema. Sembra essere un problema con pkg-config localizzando cairo durante la fase di configurazione R. La soluzione sembra essere:

export PKG_CONFIG_PATH=/opt/X11/lib/pkgconfig

in modo che R può usare correttamente cairo.

Installa R direttamente dalla sorgente, piuttosto che con homebrew, ma io uso homebrew per mantenere aggiornate le altre librerie. Questo risolve il problema per me.

Per riferimento, sto eseguendo OSX Mavericks.

fonte

2013-12-10 22:45:22

Installazione da sorgente in homebrew (cioè come 'brew install R - build-from-source') ha causato che R fosse collegato alla libreria cairo appropriata per me. –

Homebrew R costruire manca Cairo

risposta

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