La maggior parte del configurazione JIRA possono essere impostate in modo diverso per i diversi progetti. Alcune cose, come i campi personalizzati, possono anche essere impostati in modo diverso per ogni coppia di (progetto, tipo di problema).
Gli schemi sono i mezzi per configurare questi pezzi di configurazione per progetto/per tipo, con probabilmente il riutilizzo di una configurazione tra diversi progetti.
Ad esempio, la funzionalità di protezione dei problemi consente di impostare le opzioni per il campo Livello di sicurezza e limitare la visibilità dei problemi a determinati utenti in base al valore di quel campo. Problema Schema di sicurezza contiene le definizioni di tali opzioni e il modo in cui limitano la visibilità del problema.
Quindi, prima si configura l'Issue Security Scheme (può essere più di uno) per definire quella parte di configurazione, e quindi è possibile assegnare a ciascun progetto uno degli Schemi di sicurezza Issue disponibili (o nessuno dei due), applicando quindi quei pezzi di config per le questioni in quei progetti.