2013-02-19 14 views
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Sto costruendo un grafico quantile-quantile su una variabile denominata x da un frame di dati denominato df nell'esempio di lavoro fornito di seguito. Vorrei etichettare i punti con la variabile name del mio set di dati df.Come posso etichettare i punti di un grafico quantile-quantile composto con ggplot2?

È possibile farlo in ggplot2 senza ricorrere alla soluzione dolorosa (codificando la distribuzione teorica a mano e poi tracciando quella empirica)?

Modifica: succede che sì, grazie a un utente che ha pubblicato e quindi cancellato la sua risposta. Vedi i commenti dopo la risposta di Arun sotto. Grazie a Didzis per la sua soluzione altrimenti intelligente con ggbuild.

# MWE 
df <- structure(list(name = structure(c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 7L, 9L, 
10L, 6L, 12L, 13L, 14L, 15L, 16L, 17L, 19L, 18L, 20L, 21L, 22L, 
8L, 23L, 11L, 24L), .Label = c("AUS", "AUT", "BEL", "CAN", "CYP", 
"DEU", "DNK", "ESP", "FIN", "FRA", "GBR", "GRC", "IRL", "ITA", 
"JPN", "MLT", "NLD", "NOR", "NZL", "PRT", "SVK", "SVN", "SWE", 
"USA"), class = "factor"), x = c(-0.739390016757746, 0.358177826874146, 
1.10474523846099, -0.250589535389937, -0.423112615445571, -0.862144579740376, 
0.823039669834058, 0.079521521937704, 1.08173649722493, -2.03962942823921, 
1.05571087029737, 0.187147291278723, -0.144770773941437, 0.957990771847331, 
-0.0546549555439176, -2.70142550075757, -0.391588386498849, -0.23855544527369, 
-0.242781575907386, -0.176765072121165, 0.105155860923456, 2.69031085872414, 
-0.158320176671995, -0.564560815972446)), .Names = c("name", 
"x"), row.names = c(NA, -24L), class = "data.frame") 

library(ggplot2) 
qplot(sample = x, data = df) + geom_abline(linetype = "dotted") + theme_bw() 

# ... using names instead of points would allow to spot the outliers 

Sto lavorando su un adattamento di this gist, e prenderà in considerazione l'invio di altre domande a CrossValidated se ho domande circa la diagnostica di regressione, che potrebbero essere di interesse per gli utenti CV.

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qualcuno ha postato una soluzione ancora più diretta Didzis ed eliminato. Era qualcosa come 'ggplot (df, aes (sample = x)) + geom_text (label = df $ name, stat =" qq ") + geom_abline (linetype =" punteggiato ")'. Nel caso tu sia interessato. – Arun

risposta

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è possibile salvare la trama QQ originale come oggetto (usato funzione ggplot() e stat_qq() invece di qplot())

g<-ggplot(df, aes(sample = x)) + stat_qq() 

Poi con la funzione ggplot_build() è possibile estrarre i dati utilizzati per la stampa. Sono memorizzati nell'elemento data[[1]]. Salvati quei dati come nuova cornice dati.

df.new<-ggplot_build(g)$data[[1]] 
head(df.new) 
      x   y  sample theoretical PANEL group 
1 -2.0368341 -2.7014255 -2.7014255 -2.0368341  1  1 
2 -1.5341205 -2.0396294 -2.0396294 -1.5341205  1  1 
3 -1.2581616 -0.8621446 -0.8621446 -1.2581616  1  1 
4 -1.0544725 -0.7393900 -0.7393900 -1.0544725  1  1 
5 -0.8871466 -0.5645608 -0.5645608 -0.8871466  1  1 
6 -0.7415940 -0.4231126 -0.4231126 -0.7415940  1  1 

Ora è possibile aggiungere ai nomi dei frame di dati di osservazioni. È importante utilizzare order() poiché i dati nel nuovo frame di dati sono ordinati.

df.new$name<-df$name[order(df$x)] 

Ora tracciare nuova cornice di dati come al solito e, invece di fornire geom_point()geom_text().

ggplot(df.new,aes(theoretical,sample,label=name))+geom_text()+ 
    geom_abline(linetype = "dotted") + theme_bw() 

enter image description here

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(+1) uso brillante di 'ggplot_build()'. Una domanda: dove posso leggere del controllo di livello inferiore di 'ggplot2' come questi, qualche idea ?? – Arun

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@Arun Non so dove trovare le informazioni - Ho imparato questo cercando su altre domande SO –

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Oh bene, è bello. Continuerò a cercare le tue risposte! :) – Arun

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I punti sono troppo vicini. Vorrei fare qualcosa di simile:

df <- df[with(df, order(x)), ] 
df$t <- quantile(rnorm(1000), seq(0, 100, length.out = nrow(df))/100) 

p <- ggplot(data = df, aes(x=t, y=x)) + geom_point(aes(colour=df$name)) 

Questo dà:

enter image description here

Se si insiste per avere etichette all'interno della trama, allora, si potrebbe provare qualcosa di simile:

df <- df[with(df, order(x)), ] 
df$t <- quantile(rnorm(1000), seq(0, 100, length.out = nrow(df))/100) 

p <- ggplot(data = df, aes(x=t, y=x)) + geom_point(aes(colour=df$name)) 
p <- p + geom_text(aes(x=t-0.05, y=x-0.15, label=df$name, size=1, colour=df$name)) 

p 

enter image description here

È possibile giocare in giro con le coordinate x e e, se lo desideri, puoi sempre rimuovere l'estetica del colore.

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+1 Nice rainbow colors :) Penso che manchi il codice per il tuo secondo grafico? – juba

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@juba, oopsy! ho dimenticato di incollarlo.grazie per aver segnalato! – Arun

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Grazie per il suggerimento. Ho pensato a quest'ultima soluzione, ma vorrei fare a meno della creazione di dati 'rnorm 'aggiuntivi solo per la trama. –

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