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ho ridotto il mio programma al seguente esempio:Perché MPI_Barrier causare un errore di segmentazione in C++
#include <mpi.h>
int main(int argc, char * argv[]) {
int rank, size;
MPI_Init(&argc, &argv);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
MPI_Finalize();
return 0;
}
compilo ed eseguire il codice, e ottenere il seguente risultato:
My-MacBook-Pro-2:xCode_TrapSim user$ mpicxx -g -O0 -Wall barrierTest.cpp -o barrierTestExec
My-MacBook-Pro-2:xCode_TrapSim user$ mpiexec -n 2 ./barrierTestExec
================================================================================== =
= BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
= PID 21633 RUNNING AT My-MacBook-Pro-2.local
= EXIT CODE: 11
= CLEANING UP REMAINING PROCESSES
= YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
===================================================================================
YOUR APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Segmentation fault: 11 (signal 11)
This typically refers to a problem with your application.
Please see the FAQ page for debugging suggestions
Se Commentando MPI_Barrier o eseguendo il programma su un solo nodo, il codice funziona correttamente. Sto usando i seguenti compilatori:
My-MacBook-Pro-2:xCode_TrapSim user$ mpiexec --version
HYDRA build details:
Version: 3.2
Release Date: Wed Nov 11 22:06:48 CST 2015
CC: clang
CXX: clang++
F77: /usr/local/bin/gfortran
F90: /usr/local/bin/gfortran
Configure options: '--disable-option-checking' '--prefix=/usr/local/Cellar/mpich/3.2_1' '--disable-dependency-tracking' '--disable-silent-rules' '--mandir=/usr/local/Cellar/mpich/3.2_1/share/man' 'CC=clang' 'CXX=clang++' 'FC=/usr/local/bin/gfortran' 'F77=/usr/local/bin/gfortran' '--cache-file=/dev/null' '--srcdir=.' 'CFLAGS= -O2' 'LDFLAGS=' 'LIBS=-lpthread ' 'CPPFLAGS= -I/private/tmp/mpich-20160606-48824-1qsaqn8/mpich-3.2/src/mpl/include -I/private/tmp/mpich-20160606-48824-1qsaqn8/mpich-3.2/src/mpl/include -I/private/tmp/mpich-20160606-48824-1qsaqn8/mpich-3.2/src/openpa/src -I/private/tmp/mpich-20160606-48824-1qsaqn8/mpich-3.2/src/openpa/src -D_REENTRANT -I/private/tmp/mpich-20160606-48824-1qsaqn8/mpich-3.2/src/mpi/romio/include'
Process Manager: pmi
Launchers available: ssh rsh fork slurm ll lsf sge manual persist
Topology libraries available: hwloc
Resource management kernels available: user slurm ll lsf sge pbs cobalt
Checkpointing libraries available:
Demux engines available: poll select
My-MacBook-Pro-2:xCode_TrapSim user$ clang --version
Apple LLVM version 7.3.0 (clang-703.0.31)
Target: x86_64-apple-darwin15.5.0
Thread model: posix
InstalledDir: /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin
Questo sembra che dovrebbe essere un problema banale, ma io non riesco a capirlo. Perché MPI_Barrier fa sì che questo semplice codice seghi l'errore?
Non riesco a riprodurre. Il tuo codice funziona senza crash qui. – amaurea
Non sono sorpreso, è un esempio quasi banale di MPI, eppure qualunque combinazione di compilatori che ho o qualcosa non sta cooperando. Sto solo sperando che qualcuno possa averlo visto prima. – jboss
Benvenuti in SO. Anche se la tua domanda è ben fatta, è ancora difficile riprodurlo e quindi capire il tuo problema. La risposta probabile è * c'è qualcosa di sbagliato nella tua installazione MPI *, ma non è di grande aiuto. Potresti aggiungere alcuni dettagli su come hai installato MPI? In definitiva, un bug report al provider del pacchetto (supponendo che provenga da un repository) potrebbe essere più promettente. – Zulan