Errore di indirizzamento sys.excepthook in script bash

Question

Ho scritto uno script bash che sta facendo esattamente quello che voglio fare, ma calciando fuori il seguente errore:

close failed in file object destructor: sys.excepthook is missing lost sys.stderr

Sono completamente perplesso su come affrontare questo. Ecco la sceneggiatura:

#!/bin/bash 

usage() { echo "${0##*/} inputfile outputfile"; exit 1; } 

(($#==2)) || usage 

INPUTFILE="$1" 
OUTPUTFILE="$2" 

# All that is written between between the 'cat' command and 
#+ 'EOF' will be sent to the output file. 
cat <<EOF >$OUTPUTFILE 
$(date "+Generated on %m/%d/%y at %H:%M:%S") 

DATA AUDIT: $1 

------------ 
COLUMN NAMES 
------------ 

$(csvcut -n $INPUTFILE) 

--------------------------------------- 
FIRST TEN ROWS OF FIRST FIVE COLUMNS 
--------------------------------------- 

$(csvcut -c 1,2,3,4,5 $INPUTFILE | head -n 10) 

------------ 
COLUMN STATS 
------------ 

$(csvcut $INPUTFILE | csvstat) 

---END AUDIT 
EOF 

echo "Audited!" 

Sono abbastanza nuovo per gli script di shell e molto nuovo per Python. Sarei grato per qualsiasi aiuto.

Answer 1

Stavo vedendo questo errore durante il piping dell'output da uno script Python 2.6.2 nel comando head in bash su Ubuntu 9.04. Ho aggiunto try blocchi per chiudere stdout e stderr prima di uscire lo script:

try: 
    sys.stdout.close() 
except: 
    pass 
try: 
    sys.stderr.close() 
except: 
    pass 

non ho più sto vedendo l'errore.

Answer 2

Suppongo che lo script Python csvcut sia in altro modo funzionale ma genera un errore quando tenta di chiudere i file ed uscire.

Se, come dici tu, lo script funziona diversamente e si presuppone che l'errore "csvcut" stia generando output su stderr, reindirizzare a/dev/null sarebbe una correzione temporanea.

cat <<EOF >$OUTPUTFILE 2>/dev/null 

Naturalmente anche altri messaggi di errore nel tuo heredoc reindirizzeranno lì.

Answer 3

ci sono due passaggi da eseguire:

Fase 1:

Nella tua csvcut sceneggiatura, trovare tutti i luoghi dove sys.stdout.write() sono chiamati, assicurarsi sys.stdout.flush() si chiama dopo ogni write().

Fase 2:

Con la fase 1 completato si dovrebbe ora essere in grado di catturare IOError all'interno dello script Python. Di seguito è riportato un esempio su come gestire il tubo rotto:

try: 
    function_with_sys_stdout_write_call() 
except IOError as e: 
    # one example is broken pipe 
    if e.strerror.lower() == 'broken pipe': 
     exit(0) 
    raise  # other real IOError 

Spero che aiuti!