2012-06-17 18 views
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Sto scrivendo una funzione che coinvolge altre funzioni dalla base R con un sacco di argomenti. Per esempio (funzione reale è molto più lungo):come passare argomenti in funzione all'interno di una funzione in

myfunction <- function (dataframe, Colv = NA) { 
matrix <- as.matrix (dataframe) 
out <- heatmap(matrix, Colv = Colv) 
return(out) 
} 

data(mtcars) 

myfunction (mtcars, Colv = NA) 

La mappa termica ha molti argomenti che possono essere passati a:

heatmap(x, Rowv=NULL, Colv=if(symm)"Rowv" else NULL, 
     distfun = dist, hclustfun = hclust, 
     reorderfun = function(d,w) reorder(d,w), 
     add.expr, symm = FALSE, revC = identical(Colv, "Rowv"), 
     scale=c("row", "column", "none"), na.rm = TRUE, 
     margins = c(5, 5), ColSideColors, RowSideColors, 
     cexRow = 0.2 + 1/log10(nr), cexCol = 0.2 + 1/log10(nc), 
     labRow = NULL, labCol = NULL, main = NULL, 
     xlab = NULL, ylab = NULL, 
     keep.dendro = FALSE, verbose = getOption("verbose"), ...) 

voglio usare questi argomenti senza di loro messa in vendita all'interno myfunction.

myfunction (mtcars, Colv = NA, col = topo.colors(16)) 
Error in myfunction(mtcars, Colv = NA, col = topo.colors(16)) : 
    unused argument(s) (col = topo.colors(16)) 

Ho provato quanto segue ma non funzionano:

myfunction <- function (dataframe, Colv = NA) { 
matrix <- as.matrix (dataframe) 
out <- heatmap(matrix, Colv = Colv, ....) 
return(out) 
} 
data(mtcars) 

myfunction (mtcars, Colv = NA, col = topo.colors(16)) 

risposta

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Prova tre punti invece di quattro, e aggiungere l'argomento puntini di sospensione per la funzione di livello superiore:

myfunction <- function (dataframe, Colv = NA, ...) { 
    matrix <- as.matrix (dataframe) 
    out <- heatmap(matrix, Colv = Colv, ...) 
    return(out) 
} 
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Giusto per aggiungere un'opzione (o aggiungere confusione), è possibile aumentare il contenuto di '...' impostando una variabile all'interno della funzione principale 'dotfuns <-list (..., other_variable)' e passandola alle funzioni successive. Fai questo a tuo rischio e pericolo :-) –

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@CarlWitthoft scusa non ho potuto ottenere quello che vuoi dire, potrebbe espandere la tua soluzione (forse come risposta) – jon

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Non era una risposta al tuo problema specifico, solo un commento su altre cose che possono essere fatto con la '...' raccolta di argomenti. –

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