2010-08-24 15 views
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Ho un areaplot accatastati realizzato con ggplot2:ggplot2: overlay linea gruppo di controllo sul pannello grafico set

dists.med.areaplot<-qplot(starttime,value,fill=dists,facets=~groupname, 
    geom='area',data=MDist.median, stat='identity') + 
    labs(y='median distances', x='time(s)', fill='Distance Types')+ 
    opts(title=subt) + 
    scale_fill_brewer(type='seq') + 
    facet_wrap(~groupname, ncol=2) + grect #grect adds the grey/white vertical bars 

Ecco come si presenta: stacked area graph

Voglio aggiungere un una sovrapposizione del profilo del grafico di controllo (in basso a destra) a tutti i grafici nell'output (groupname == rowH è il controllo).

Finora i miei sforzi hanno dato questo:

cline<-geom_line(aes(x=starttime,y=value), 
    data=subset(dists.med,groupname=='rowH'),colour='red') 

dists.med.areaplot + cline 

problem graph

Ho bisogno le 3 linee rosse per essere 1 linea rossa che sfiora la parte superiore della sezione blu scuro. E ho bisogno di quella linea identica (la riga rowH) per sovrapporre ciascuno dei pannelli.

Il dataframe assomiglia a questo:

> str(MDist.median) 
'data.frame': 2880 obs. of 6 variables: 
$ groupname: Factor w/ 8 levels "rowA","rowB",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ fCycle : Factor w/ 6 levels "predark","Cycle 1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ fPhase : Factor w/ 2 levels "Light","Dark": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ... 
$ starttime: num 0.3 60 120 180 240 300 360 420 480 540 ... 
$ dists : Factor w/ 3 levels "inadist","smldist",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 
$ value : num 110 117 115 113 114 ... 

La linea rossa deve essere calcolato come la somma del value ad ogni starttime, dove groupname = 'rowH'. Ho provato a creare cline i seguenti modi. Ogni risultato di un errore o di un'uscita errata:

#sums the entire y for all points and makes horizontal line 
cline<-geom_line(aes(x=starttime,y=sum(value)),data=subset(dists.med,groupname=='rowH'),colour='red') 

#using related dataset with pre-summed y's 
> cline<-geom_line(aes(x=starttime,y=tot_dist),data=subset(t.med,groupname=='rowH')) 
> dists.med.areaplot + cline 
Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'dists' not found 

Pensieri?

ETA:

Sembra che il problema che stavo avendo con 'dists' not found ha a che fare con il fatto che la trama iniziale, dists.med.areaplot è stato creato tramite qplot. Per evitare questo problema, non riesco a costruire su un qplot. Questo è il codice per la trama di lavoro:

cline.data <- subset(
     ddply(MDist.median, .(starttime, groupname), summarize, value = sum(value)), 
     groupname == "rowH") 
cline<-geom_line(data=transform(cline.data,groupname=NULL), colour='red') 

dists.med.areaplot<-ggplot(MDist.median, aes(starttime, value)) + 
    grect + nogrid + 
    geom_area(aes(fill=dists),stat='identity') + 
    facet_grid(~groupname)+ scale_fill_brewer(type='seq') + 
    facet_wrap(~groupname, ncol=2) + 
    cline 

conseguente questo graphset: alt text

risposta

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questo post del blog di apprendimento R dovrebbe essere di qualche aiuto:

http://learnr.wordpress.com/2009/12/03/ggplot2-overplotting-in-a-faceted-scatterplot/

Potrebbe essere vale la pena calcolare il riepilogo al di fuori di ggplot con plyr.

cline.data <- ddply(MDist.median, .(starttime, groupname), summarize, value = sum(value)) 
cline.data.subset <- subset(cline.data, groupname == "rowH") 

quindi aggiungerlo alla trama con

last_plot() + geom_line(data = transform(cline.data.subset, groupname = NULL), color = "red") 
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Non credo che si desidera rimuovere la variabile 'groupname'. – hadley

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Se si rimuove 'groupname', non lo farà quindi tracciare la linea su tutte le faccette? – JoFrhwld

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Hmm, forse ho frainteso la domanda. – hadley

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