Come eseguire R su Google Compute Engine senza errori di segmentazione

Question

Sto provando a utilizzare il motore di calcolo di Google per eseguire R, sebbene continui a scovare errori di segmentazione. Ecco cosa ho fatto finora:

1) Ho installato Cygwin & Google Cloud SDK e correttamente autenticato su Google Cloud Platform.

2) Ho creato una macchina virtuale utilizzando l'immagine "debian-7-wheezy-v20140318" fornita da google con una macchina "n1-standard-4".

3) Ho installato R (con software add'l) su questa macchina virtuale utilizzando i comandi

sudo apt-get update 
sudo apt-get install -y libopenblas-base openmpi-bin libopenmpi-dev r-base openjdk-7-jre openjdk-7-jdk 

4) Ho verificato il software è installato con il comando

apt-cache policy r-base 

che restituisce che v2.15.1-4 è installato.

Ogni volta che provo a presentare una semplice R-script per installare alcuni pacchetti comuni R (tramite il comando "sudo R CMD LOTTO --no-save installRpkgs.R"), il registro di uscita mi dà l'errore

Quando ssh nella macchina virtuale provo a eseguire R esplicitamente, ottengo lo stesso errore. Ho la sensazione che mi manchi qualcosa. Forse ho bisogno di specificare la memoria o scrivere autorizzazioni. Non sono sicuro, perché sono ancora nuovo nel cloud computing. Se qualcuno potesse aiutare a TUTTI, sarei così grato.

Grazie!

MODIFICA: Dopo aver risolto il problema, sono riuscito a stabilire che il colpevole è "libopenblas-base". Non sono sicuro del motivo per cui lo sta causando, ma per ora ho continuato senza di esso.

Answer 1

È possibile installare il pacchetto "strace", quindi eseguire "sudo strace R CMD BATCH --no-save installRpkgs.R" per vedere quali chiamate vengono effettuate e il loro stato di uscita. Sfortunatamente non ho familiarità con il problema che stai avendo, ma strace può essere immensamente utile per scoprire quale sia il problema quando c'è poco o nessun output dal programma stesso.