Come filtrare le righe di un python pita il dataframe da un altro dataframe confrontando le colonne?

Question

sto cercando di escludere righe da una dataframe, che si verificano anche in un'altra dataframe:

import pandas 

df = pandas.DataFrame({'A': ['Chr1', 'Chr1', 'Chr1','Chr1', 'Chr1', 'Chr1','Chr2','Chr2'], 'B': [10,20,30,40,50,60,15,20]}) 

errors = pandas.DataFrame({'A': ['Chr1', 'Chr1'], 'B': [20,50]}) 

Di conseguenza, le righe df, che sono uguali a errori devono essere lasciati fuori:

df: 
'A' 'B' 
Chr1 10 
Chr1 30 
Chr1 40 
Chr1 60 
Chr2 15 
Chr2 20 

Non sembra funzionare con df.merge e non voglio scorrere tutte le righe, poiché i datafram diventano piuttosto grandi.

migliore,

David

Answer 1

Aggiungi una colonna in più per gli errori

errors['temp'] = 1 

Unire i due dataframes

merged_df = pandas.merge(df,errors,how='outer') 

Ora tenere solo le righe che hanno 'temp' come NaN

merged_df = merged_df[ merged_df['temp'] != 1 ] 
del merged_df['temp'] 

print merged_rdf 

     A B 
0 Chr1 10 
2 Chr1 30 
3 Chr1 40 
5 Chr1 60 
6 Chr2 15 
7 Chr2 20 

Answer 2

Per due colonne che si può fare:

print df[ ~df['A'].isin(errors['A']) | ~df['B'].isin(errors['B']) ]