Installazione di numpy come dipendenza con setuptools

Question

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Sto usando setuptools per installare un mio pacchetto. Come dipendenza ho elencato numpy. Sto usando Python2.7 e quando lo faccio

python setup.py install 

con questo setup.py lima:

from setuptools import setup 

setup(name = "test_pack", install_requires = ["numpy"]) 

io alla fine con questo messaggio di errore:

ImportError: No module named numpy.distutils 

Di cosa ho bisogno di fare per includere numpy come dipendenza e installarlo senza aver installato python-dev?

---

L'uscita completa di python setup.py install:

running install 
running bdist_egg 
running egg_info 
writing requirements to test_pack.egg-info/requires.txt 
writing test_pack.egg-info/PKG-INFO 
writing top-level names to test_pack.egg-info/top_level.txt 
writing dependency_links to test_pack.egg-info/dependency_links.txt 
reading manifest file 'test_pack.egg-info/SOURCES.txt' 
writing manifest file 'test_pack.egg-info/SOURCES.txt' 
installing library code to build/bdist.linux-x86_64/egg 
running install_lib 
creating build/bdist.linux-x86_64/egg 
creating build/bdist.linux-x86_64/egg/test_pack 
copying build/lib/test_pack/__init__.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/test_pack 
copying build/lib/test_pack/mod.py -> build/bdist.linux-x86_64/egg/test_pack 
byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/test_pack/__init__.py to __init__.pyc 
byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/test_pack/mod.py to mod.pyc 
creating build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO 
copying test_pack.egg-info/PKG-INFO -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO 
copying test_pack.egg-info/SOURCES.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO 
copying test_pack.egg-info/dependency_links.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO 
copying test_pack.egg-info/requires.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO 
copying test_pack.egg-info/top_level.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO 
creating 'dist/test_pack-0.0.0-py2.7.egg' and adding 'build/bdist.linux-x86_64/egg' to it 
removing 'build/bdist.linux-x86_64/egg' (and everything under it) 
Processing test_pack-0.0.0-py2.7.egg 
Copying test_pack-0.0.0-py2.7.egg to /home/woltan/local/lib/python2.7/site-packages 
Adding test-pack 0.0.0 to easy-install.pth file 

Installed /home/woltan/local/lib/python2.7/site-packages/test_pack-0.0.0-py2.7.egg 
Processing dependencies for test-pack==0.0.0 
Searching for numpy 
Reading http://pypi.python.org/simple/numpy/ 
Reading http://numpy.scipy.org 
Reading http://sourceforge.net/project/showfiles.php?group_id=1369&package_id=175103 
Reading http://numeric.scipy.org 
Best match: numpy 1.6.1 
Downloading http://pypi.python.org/packages/source/n/numpy/numpy-1.6.1.zip#md5=462c22b8eb221c78ddd51de98fbb5979 
Processing numpy-1.6.1.zip 
Running numpy-1.6.1/setup.py -q bdist_egg --dist-dir /tmp/easy_install-AoFmdV/numpy-1.6.1/egg-dist-tmp-JH1j2R 
non-existing path in 'numpy/distutils': 'site.cfg' 
Could not locate executable g77 
Found executable /opt/solstudio12.2/bin/f77 
gnu: no Fortran 90 compiler found 
gnu: no Fortran 90 compiler found 
Found executable /opt/intel/Compiler/11.1/073/bin/intel64/ifort 
Could not locate executable lf95 
Could not locate executable pgf90 
Could not locate executable pgf77 
Found executable /opt/solstudio12.2/bin/f90 
Found executable /opt/solstudio12.2/bin/f95 
Could not locate executable fort 
_configtest.c:1: warning: conflicting types for built-in function ‘exp’ 
_configtest.o: In function `main': 
/tmp/easy_install-AoFmdV/numpy-1.6.1/_configtest.c:6: undefined reference to `exp' 
collect2: ld returned 1 exit status 
_configtest.c:1: warning: conflicting types for built-in function ‘exp’ 
_configtest.c:1:20: error: Python.h: No such file or directory 
_configtest.o: In function `main': 
/tmp/easy_install-AoFmdV/numpy-1.6.1/_configtest.c:6: undefined reference to `exp' 
collect2: ld returned 1 exit status 
_configtest.c:1:20: error: Python.h: No such file or directory 

Answer 1

A meno che non si ha accesso a una distribuzione binaria (pre-compilato/built) per NumPy, dovrete avere le intestazioni pitone disponibili come li ha bisogno di costruire numpy. Questo è il motivo per cui la maggior parte dei gestori di pacchetti ha versioni precompilate di questi pacchetti. Ad esempio puoi apt-get install python-numpy, collegarlo al tuo virtualenv e quando provi ad installare il tuo programma con install_requires=['numpy'] dovrebbe vedere che è già installato.

Answer 2

Per installare numpy, setuptools scaricherà il pacchetto e lo compilerà dal sorgente. Tuttavia, ci sono alcuni prerequisiti per compilare numpy, è possibile verificarlo here.

_configtest.c:1:20: error: Python.h: No such file or directory 

Questo errore indica che almeno non devi pacchetto python-dev installato (se si utilizza Ubuntu/Debian).

Answer 3

Questo è un problema noto, monitorato su numpy/numpy #2434.

Ho trovato una soluzione per questo: aggiungi numpy a setup_requires. Averlo in entrambi setup_requires e install_requires sembra funzionare bene con la versione più recente di setuptools.

Così, il vostro setup.py dovrebbe essere simile a

setup(
    # Your setup specific stuff here 
    setup_requires=["numpy"], # Just numpy here 
    install_requires=["numpy"], # Add any of your other dependencies here 
)